Регионом деятельности СЗТУ является Северо-Западный Федеральный округ площадью 1 679,1 тыс. кв. км, на территории которого действуют 11 субъектов Российской Федерации.

СЗТУ - единственное управление, которое имеет границы с Европейским Союзом. Этим обусловлено проведение активного процесса интеграции в европейские таможенные технологии на основе комплексной автоматизации таможенной деятельности.

Протяженность участка таможенной границы в зоне деятельности СЗТУ - 3637 км. Из них сухопутная часть составляет 2375 км, морская - 233 км и озерная (речная) - 224 км.

Сегодня в таможенных органах на Северо-Западе России работает более 12 тысяч человек. В системе Федеральной таможенной службы СЗТУ является не только одним из самых крупных по численному составу, но и лидирующим по достигнутым результатам.

Регион граничит с Финляндией, Норвегией, Польшей, Республикой Беларусь, странами Балтии: Латвией, Литвой, Эстонией. На границу с Финляндией приходится 1320,8 км, с Латвией - 270,5 км, с Эстонией - 464,8 км, Норвегией - 219,1 км.

На сегодня в структуру управления входят 16 таможен. Они объединяют 121 таможенный пост, расположенный на подведомственной СЗТУ территории площадью более 1 600 тысяч квадратных километров, которые в свою очередь находятся в 11 субъектах Российской Федерации.

Северо-Западный участок таможенной границы считается одним из самых обустроенных в стране. За годы деятельности СЗТУ в округе были введены в эксплуатацию автопереходы: в 1993 году в строй Лотта на границе с Финляндией, Борисоглебск - с Норвегией и Ивангород - с Эстонией, в 1994 году - на финском участке МАПП Вяртсиля с пропускной способностью 870 автомобилей в сутки, на эстонском - МАПП Куничина Гора (500 автомобилей в сутки), МАПП Убылинка (2000 автомобилей), на латвийском - МАПП Бурачки (2000 автомобилей).

1997 год ознаменовался вводом на границе с Финляндией сразу двух МАПП: Торфяновка, рассчитанного на ежесуточное оформление 3500 транспортных средств, и Люття - 300 автомобилей. Немногим позже здесь же, на Выборгском направлении, были сданы в эксплуатацию пункты Брусничное (2400 автомобилей) и Светогорск, а также Борисоглебск в составе Мурманской таможни.

В начале октября 2006 года состоялась официальная церемония открытия МАПП Суоперя (более 150 автомобилей в сутки), расположенного в Республике Карелия. А в середине 2008 года был открыт новый пункт пропуска в Калининградском регионе – МАПП Чернышевское.

На морском участке границы в регионе деятельности СЗТУ находится 12 таможенных судов, в том числе вступившее в строй в августе 2003 года большое таможенное судно ТС-101 «Меркурий». Экипажам приходится выполнять задачи в акваториях портов, шхерных районах Выборгского залива, на пограничных реках и озерах.

В декабре 1994 года в структуре СЗТУ появился авиационный отдел, который в полном объеме самостоятельно осуществляет летно-техническую эксплуатацию воздушных судов.

Итоги деятельности СЗТУ за 2009 год:

В 2009 году таможенными органами управления перечислено в федеральный бюджет страны почти 470 млрд. рублей. Плановое задание 2009 года выполнено на 101,71%. Доля импортной составляющей от общего объема перечислений составила 63,5%, экспортной - 35,5%.

В ходе работы коллегии было отмечено, что несмотря на уменьшение объемов внешнеторгового оборота в регионе на 28%, сокращение фактических перечислений в федеральный бюджет Российской Федерации по сравнению с 2008 годом произошло лишь на 11,3%.  

В 2009 году внешнеторговый оборот в регионе деятельности СЗТУ составил 72 млрд. доллара США. В товарной структуре импорта произошли существенные изменения: вырос удельный вес продовольственных товаров, снизилась доля машин, оборудования и транспортных средств. Основные позиции в товарной структуре импорта занимают продукция машиностроительной промышленности (37,4%), продовольственные товары (31,8%) и продукция химической промышленности (11,6%).

Основные позиции в товарной структуре экспорта занимают топливо, продукция химической промышленности и металлы. 

В 2009 году таможенными органами региона было оформлено 808 208 ГТД, из них экспортных – 211 089, импортных – 597 119.

Особое внимание члены коллегии уделили обсуждению реализации Концепции таможенного оформления и таможенного контроля в местах, приближенных к государственной границе Российской Федерации, созданию таможенно-логистических терминалов (ТЛТ). На сегодняшний день это одно из приоритетных направлений деятельности СЗТУ. В рамках данной работы в истекшем году ликвидирован Железнодорожный таможенный пост Санкт-Петербургской таможни. С 1 марта 2010 года в её структуре ликвидируется Северный таможенный пост. С 1 июля 2009 года Великолукская таможня реорганизована путем присоединения к Себежской таможне. В структуре Себежской таможни  на участке российско-латвийской границы начал функционировать новый таможенный пост Овинковский. На посту будет осуществляться полный цикл таможенного оформления товаров. С 1 октября 2009 года для обеспечения деятельности многостороннего автомобильного пункта пропуска «Лудонка-Виентули» в структуре Псковской таможни создан новый таможенный пост МАПП Лудонка. В настоящее время в регионе деятельности СЗТУ функционируют 16 таможен и 118 таможенных постов.

Продолжалась работа по внедрению в таможнях региона электронного декларирования. В настоящее время 56 таможенных постов таможен СЗТУ обладают правомочиями производить таможенное оформление товаров, декларируемых в электронной форме. В истекшем году таможнями СЗТУ оформлено свыше 59 тысяч ГТД в электронной форме, что на 17 % превышает данный показатель деятельности таможенных органов за аналогичный период 2008г.

Члены коллегии единодушно отметили, что правоохранительная деятельность таможенных органов региона в 2009 году характеризуется положительной динамикой, при этом приоритетное внимание уделялось пресечению незаконного ввоза в РФ наркотических средств. В истекшем году возбуждено 1251 уголовное дело, (в аналогичном периоде 2008 года – 1096 дел), 18 575 дел об административных правонарушениях. В 2009 году таможенниками СЗТУ из незаконного оборота изъято около свыше 166 кг наркотических средств и свыше 1 кг сильнодействующих и психотропных веществ. 

В 2009 году службой собственной безопасности Северо-Западного таможенного управления и отделами собственной безопасности таможен Северо-Западного таможенного управления зарегистрировано и направлено в органы прокуратуры 315 материалов об обнаружении признаков должностных преступлений совершенных должностными лицами таможенных органов СЗТУ, по результатам которых возбуждено 174 уголовных дела.

Отношение количества коррупционных преступлений, выявленных непосредственно службой собственной безопасности СЗТУ к общему числу преступлений этой направленности, выявленных всеми правоохранительными органами, в 2009 году составило 98%.    

В своих докладах преставители ФТС России отметили, что в 2009 году в результате принятых мер СЗТУ удалось выполнить годовое плановое задание, добиться весомых результатов по многим приоритетным направлениям. Они также подчеркнули важность деятельности таможенных органов Северо-Запада – региона, граничащего со многими странами, в том числе Евросоюза, поэтому роль таможенников СЗТУ в обеспечении экономической безопасности страны, наполнении ее доходной части велика и ответственна в современных условиях, особенно в 2010 году. 

В ходе обсуждения и всестороннего анализа итогов деятельности СЗТУ в 2009 году, члены коллегии отметили, что выполнение поставленных перед управлением задач стало возможным благодаря целенаправленной работе таможенных органов СЗТУ по обеспечению достоверного декларирования, осуществлению контроля таможенной стоимости, применению системы управления рисками, пресечению попыток контрабандного перемещения через таможенную границу товаров и транспортных средств. 

Важным моментом в работе коллегии стало определение задач СЗТУ на 2010 год. Согласно решения заседания коллегии основные усилия таможенных органов региона в текущем году буду направлены на безусловное выполнение задач по перечислению денежных средств в федеральный бюджет, повышение эффективности борьбы с контрабандой товаров и незаконным оборотом наркотиков, недостоверным декларированием. По-прежнему приоритетными направлениями деятельности СЗТУ остаются обеспечение реализации Концепции таможенного оформления и таможенного контроля товаров в местах, приближенных к Государственной границе Российской Федерации, применение современных технологий таможенного оформления и таможенного контроля. Активно будет продолжена работу по борьбе с коррупционными проявлениями.

Реализация изложенного позволит в текущем году выполнить те задачи, которые ставит перед таможенными органами Президент, Правительство Российской Федерации и Федеральная таможенная служба.